26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3051 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  100 
 
 		 125 aa  261  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  63.73 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  56.19 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  58.65 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  47.47 
 
 		 111 aa  113  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  59.46 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  47.41 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  52.83 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  50.45 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  43.14 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  52.94 
 
 		 163 aa  93.2  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  46.91 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  38.37 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  31.18 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  29.17 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  28.28 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  29.9 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  28.72 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  32.79 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  43.86 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  31.82 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  30 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  35.09 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0849  putative ATP synthase protein I  37.35 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  33.9 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>