32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0465 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  100 
 
 		 127 aa  260  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  58.33 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  66.06 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  47.46 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  52.04 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  55.14 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  47.41 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  48.8 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  44.55 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  38.32 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  53.42 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  46.59 
 
 		 106 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  43.75 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  39.51 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  47.46 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  39.44 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  30.19 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  39.44 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  40.54 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  33.33 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  38.81 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  37.68 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  37.68 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  37.68 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  37.68 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  41.07 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  37.68 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  37.68 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  30.43 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  26.67 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0469  glycosyltransferase  34.48 
 
 		 524 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171688  normal  0.657168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  46.15 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>