31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2792 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  100 
 
 
166 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  100 
 
 
166 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  97.59 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  97.59 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  97.59 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  98.18 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  73.37 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  65.62 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  73.68 
 
 
104 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  59.14 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  72.22 
 
 
105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  70.59 
 
 
84 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  66.67 
 
 
95 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  45.26 
 
 
105 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  61.73 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  61.73 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  37.18 
 
 
127 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  26.92 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  29.67 
 
 
112 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  56.1 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  35.48 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  29.59 
 
 
126 aa  54.3  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  30.84 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  39.68 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  26.09 
 
 
96 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  32.86 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  30.23 
 
 
111 aa  47.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  41.82 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  32.65 
 
 
111 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  42.55 
 
 
111 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  36.23 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>