20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2991 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  100 
 
 		 122 aa  250  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  44.86 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  44.86 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  42.11 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  38.32 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  50.57 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  43.14 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  39.52 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  55.56 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  44.19 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  41.44 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  41.96 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  37.5 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  34.43 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  29.63 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  33.33 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  27.55 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  33.9 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  31.67 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  32.73 
 
 		 162 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>