33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1127 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  100 
 
 
104 aa  206  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  78.49 
 
 
105 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  69.57 
 
 
103 aa  127  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  67.96 
 
 
105 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  72.6 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  75.36 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  60.2 
 
 
95 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  75.34 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  75.34 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  75.34 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  75.34 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  75.34 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  75.34 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  60.71 
 
 
121 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  60.71 
 
 
121 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  41.41 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  34.74 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  34.88 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  31.91 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  25.56 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  39.06 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  41.54 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  32.81 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  37.5 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  30.3 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  44.23 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  51.22 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  39.34 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  38.71 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  38.16 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  37.93 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  36.49 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  30.95 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>