30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2775 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  100 
 
 		 84 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  68.67 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  73.91 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  75.36 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  78.46 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  69.23 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  61.45 
 
 		 95 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  71.88 
 
 		 166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  71.88 
 
 		 166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  71.88 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  71.88 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  71.88 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  71.88 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  45.78 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  54.88 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  54.88 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  60.98 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  38.36 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  38.81 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  29.27 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  43.33 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  29.63 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  30.67 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  40 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  30.95 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  35.85 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  37.25 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  37.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  35.09 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  23.29 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>