35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1791 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  42 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  35.21 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  35.77 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  33.79 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  36.73 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  34.27 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  29.93 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  32.64 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  32.03 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  25.71 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  29.5 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  32.17 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  28.77 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  27.01 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  29.85 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  33.63 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  34.96 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  28.99 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  27.94 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01152  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0789767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  28.45 
 
 		 192 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  29.06 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  26.77 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  27.5 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203915 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  30.88 
 
 		 435 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.15 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  28.3 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  26.12 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>