30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4624 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  47.92 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  44.37 
 
 
152 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  42.38 
 
 
175 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  43.23 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  43.51 
 
 
157 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  42.38 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  39.47 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  39.04 
 
 
178 aa  103  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  39.22 
 
 
158 aa  97.1  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  34.25 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  38.13 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  35.21 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  39.26 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  33.56 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  37.4 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  33.81 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  33.56 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  37.88 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  32.65 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  32.65 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  32.65 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11119  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
399 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0732122  normal  0.0501614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  29.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  28.19 
 
 
192 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  37.93 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  34.52 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>