32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1996 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  40.94 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  45.39 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  40.4 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  40.97 
 
 		 153 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  40.94 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  40.24 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  41.54 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  40.4 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  37.64 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  37.75 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  40.54 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  39.31 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  30.57 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  36.57 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  30.25 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  26.63 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  25.81 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  25.89 
 
 		 435 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11119  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 399 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0732122  normal  0.0501614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>