18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1995 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  354  3.9999999999999996e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  37.64 
 
 
181 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  37.12 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  31.03 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  34.55 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  28.97 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  27.78 
 
 
151 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  29.29 
 
 
158 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  33.68 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  33.02 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  23.84 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  34.15 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  28.44 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  28.1 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  27.19 
 
 
165 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  31.71 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  28.3 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>