35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1562 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  49.66 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  42.76 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  41.03 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  38.26 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  40.4 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  43.41 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  41.06 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  42.11 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  40.94 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  40.76 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  37.91 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  40.52 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  39.29 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  37.06 
 
 		 152 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  32.8 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  34.25 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  35.1 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  35.61 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  32.69 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  34.85 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  33.08 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  25.71 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  33.91 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  26.87 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11119  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0732122  normal  0.0501614 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  28.97 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  25.37 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  24.06 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>