29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1647 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  81.58 
 
 
152 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  44.37 
 
 
156 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  43.05 
 
 
151 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  44.74 
 
 
180 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  43.23 
 
 
157 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  37.06 
 
 
180 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  37.59 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  37.76 
 
 
178 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  36.36 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  38.57 
 
 
158 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  32.87 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  36.76 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  35.33 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  42.06 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  35.61 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  31.33 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  29.33 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  34.33 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  34.33 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  34.33 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  31.33 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  31.61 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  31.72 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  31.54 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  30.6 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  28.46 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  26.96 
 
 
435 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>