36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2282 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  42.76 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  42.36 
 
 
178 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  39.73 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  41.22 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  43.97 
 
 
158 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  38 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  42.66 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  41.22 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  40.41 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  40.56 
 
 
159 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  37.41 
 
 
154 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  37.68 
 
 
180 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  35.77 
 
 
175 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  40.54 
 
 
181 aa  100  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  32.21 
 
 
152 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  35.57 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  35.29 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  32.87 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  33.81 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  29.93 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  38.52 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11119  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 
399 aa  75.1  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0732122  normal  0.0501614 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  33.57 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  32.85 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  31.75 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  31.75 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  31.75 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  30.22 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  28 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  33.02 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0895  hypothetical protein  28.76 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.708178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  25.64 
 
 
435 aa  48.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  32.82 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  25.69 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0203915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>