18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3575 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  79.19 
 
 		 173 aa  291  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  31.79 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  30.15 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  27.82 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  29.29 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  28.92 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  28.91 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  30.37 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  28 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  23.65 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  28.47 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  25.37 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  25.18 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  27.14 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  24.81 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>