18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3346 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  357  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  79.19 
 
 		 173 aa  291  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  26.81 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  27.74 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  26.39 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  26.95 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  28.91 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  26.83 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  27.41 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  22.97 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  28.15 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  26.51 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  24.06 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  25.69 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  27.5 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  23.68 
 
 		 180 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  28.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>