32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2877 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  36.31 
 
 
158 aa  88.2  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  32.69 
 
 
180 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  39.23 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  39.32 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  34.67 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  37.88 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  42.06 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  31.48 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  33.59 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  37.88 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  30.67 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  36.96 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  33.61 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  30.57 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  28.03 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  28.03 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  28.03 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  38.1 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  32.1 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  28.74 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  33.58 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  34.96 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  33.07 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  31.91 
 
 
192 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  29.29 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  26.39 
 
 
173 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0203915 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  27.19 
 
 
172 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  28.91 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>