33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2822 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  62.09 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  45.89 
 
 
153 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  41.03 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  43.71 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  45.7 
 
 
159 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  42.55 
 
 
151 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  43.24 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  39.01 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  40.41 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  37.66 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  35.29 
 
 
181 aa  98.2  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  40.56 
 
 
180 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  36.81 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  36.43 
 
 
175 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  39.26 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  35.33 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  32.26 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  32.1 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  29.5 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  33.97 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  29.3 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  37 
 
 
435 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  33.11 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  32.85 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  32.85 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  32.85 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  27.41 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  26.83 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0203915 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  30.6 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11119  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
399 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0732122  normal  0.0501614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>