28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3838 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  310  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  81.58 
 
 		 152 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  42.38 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  41.45 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  37.09 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  41.29 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  32.21 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  36.55 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  35.61 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  37.14 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  35.29 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  30.46 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  35.37 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  32.64 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  33.1 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  31.97 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  32.19 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  32.19 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  32.19 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  32.19 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  30.08 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  28.97 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  28.08 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  26.61 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>