32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0801 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  49.66 
 
 		 180 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  43.8 
 
 		 178 aa  127  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  46.72 
 
 		 180 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  46.03 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  43.57 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  43.07 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  40.85 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  44.68 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  41.43 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  39.74 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  40.4 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  36.81 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  35.25 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  38.13 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  38.56 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  41.04 
 
 		 192 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  36.31 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  38.57 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  37.88 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  29.85 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  29.93 
 
 		 435 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  24.81 
 
 		 173 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>