31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0894 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 173 aa  356  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  35.75 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  38.86 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0842  hypothetical protein  32.22 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  33.75 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  27.01 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  24.85 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  24.29 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  22.28 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  27.52 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  25.6 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  25.6 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  22.09 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  23.03 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  29.89 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  25.19 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  29.82 
 
 		 423 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  22.7 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  26.67 
 
 		 432 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  25.29 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  22.08 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  24.85 
 
 		 445 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  22.29 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  25.23 
 
 		 182 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  25.64 
 
 		 476 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  26.56 
 
 		 477 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  25.77 
 
 		 482 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  25.76 
 
 		 470 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  25.85 
 
 		 476 aa  40.8  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  22.29 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>