24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1020 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  95.05 
 
 		 182 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  60 
 
 		 183 aa  227  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  59.22 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  34.08 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  34.08 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  34.08 
 
 		 180 aa  127  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  33.7 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  24.86 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  23.16 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  26.25 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  26.09 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  26.25 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  27.68 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  24.22 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  23.03 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  22.78 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  26.6 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  26.78 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  26.36 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  25.23 
 
 		 173 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>