26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0581 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  78.89 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  41.76 
 
 
183 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  35.59 
 
 
183 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  34.08 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.64 
 
 
182 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  33.53 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  25.41 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  26.55 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  23.73 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  26.58 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  23.33 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  23.89 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  31.93 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  30.07 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  30.07 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  32.2 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  31.93 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  30.4 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  22.6 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  22 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  25.6 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  25.21 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  30.53 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>