38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0840 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0842  hypothetical protein  67.1 
 
 		 181 aa  201  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  35.75 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  39.55 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  31.11 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  29.05 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  28.07 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.61 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  30.25 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  32.1 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  33.66 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  32.89 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  30.82 
 
 		 472 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  26.32 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  23.03 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.65 
 
 		 423 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  32.41 
 
 		 436 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  33.06 
 
 		 432 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  31.94 
 
 		 465 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  28 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.13 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  29.38 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  26.36 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  28.21 
 
 		 445 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  30.53 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  31.07 
 
 		 488 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  30.53 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  29.9 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  23.53 
 
 		 493 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  30.95 
 
 		 442 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  27.65 
 
 		 491 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  23.53 
 
 		 181 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  28.68 
 
 		 470 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  29.31 
 
 		 438 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  27.84 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>