26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0862 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  95.02 
 
 
201 aa  360  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  95.02 
 
 
201 aa  360  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  62.26 
 
 
211 aa  241  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  61.5 
 
 
193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  59.89 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  36.11 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  38.64 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  30.48 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  31.84 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  31.44 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  31.52 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  29.85 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.63 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  30.54 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  33.16 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  32.76 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  29.56 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  31.36 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.26 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  26.09 
 
 
182 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  32.2 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  32.2 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  32.2 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  28 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  27.94 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>