23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0892 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  95.05 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  59.55 
 
 
183 aa  220  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  58.66 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  34.64 
 
 
180 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  34.64 
 
 
180 aa  131  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  35.2 
 
 
180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  33.71 
 
 
183 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  25.42 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  24.29 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  23.63 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  27.33 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  26.25 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  25.56 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  24.31 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  26.25 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  24.22 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  22.53 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  26.6 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  26.78 
 
 
177 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  27.13 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>