26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1321 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  60 
 
 		 182 aa  227  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  59.55 
 
 		 182 aa  220  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  53.11 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  35.59 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  35.59 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  34.09 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  33.88 
 
 		 183 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  28.89 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  28.25 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.22 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  27.68 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  30.06 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  29.75 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  29.75 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  29.56 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  25.54 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  26.49 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  24.85 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  26.59 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  25.95 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  25 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>