24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0624 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  59.22 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  58.66 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  53.11 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  35.56 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  35.52 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  25.99 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  28.89 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  27.67 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  25.84 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  31.36 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  25.56 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  23.75 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  24.28 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  30.63 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  23.3 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  23.03 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  27.68 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  26.83 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 181 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>