25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0881 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  41.76 
 
 
180 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  41.76 
 
 
180 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  40.11 
 
 
180 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  33.88 
 
 
183 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  33.7 
 
 
182 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.71 
 
 
182 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  35.52 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  26.4 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.93 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  29.38 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  27.37 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  27.37 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  26.11 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  30.22 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  33.07 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  29.12 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  28.81 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  32.69 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  33.51 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  30.3 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  26.74 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>