28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2071 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  83.42 
 
 		 187 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  80.21 
 
 		 187 aa  313  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  70.21 
 
 		 194 aa  276  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  74.05 
 
 		 192 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  71.43 
 
 		 192 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  68.13 
 
 		 192 aa  260  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  50.3 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  31.55 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  33.15 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  27.93 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  31.71 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  28.41 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  32.54 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  32.54 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  32.54 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  23.16 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  29.61 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  28.81 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.31 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  23.33 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  23.33 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  24.28 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  23.03 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  22.28 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  27.93 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>