23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1633 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  42.25 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  37.43 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  37.43 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  35.05 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  33.88 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  36.26 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  30.73 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.72 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  28.49 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  28.72 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  30.49 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  26.37 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  22.64 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  22.64 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  24.88 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  26.29 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  22.42 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  25.41 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>