25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2360 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  440  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  39.25 
 
 
214 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  38.28 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  39.53 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  35.85 
 
 
221 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  36.71 
 
 
213 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  30.99 
 
 
213 aa  121  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  34.11 
 
 
213 aa  117  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  34.11 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  30.66 
 
 
211 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  31.9 
 
 
213 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  32.69 
 
 
209 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  32.04 
 
 
212 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  31.63 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  30.05 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  28.99 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  26.32 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  27.23 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  27.98 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  29.27 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  26.11 
 
 
160 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  24.41 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  21.8 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  29.91 
 
 
145 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>