25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1832 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  64.49 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  63.55 
 
 
213 aa  278  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  47.47 
 
 
215 aa  191  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  43.66 
 
 
213 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  46.48 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  44.29 
 
 
213 aa  170  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  43.54 
 
 
221 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  42.33 
 
 
193 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  40.28 
 
 
212 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  39.25 
 
 
213 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  39.23 
 
 
212 aa  141  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  35.89 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  34.3 
 
 
208 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  29.91 
 
 
213 aa  98.2  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  29.78 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  29.77 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  29.91 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  40.52 
 
 
145 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  29.91 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  26.42 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  27.75 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>