25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3209 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  36.74 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  32.86 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  30.66 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  31.25 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  30.92 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  32.08 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  28.17 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  29.3 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  31.92 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  30.54 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  28.17 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  32.08 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  28.5 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  29.25 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  28.04 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  29.91 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  30.86 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  27.32 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  28.84 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  25.46 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  34.71 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  27.5 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  24.41 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  24.86 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>