25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1834 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  59.15 
 
 
213 aa  256  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  59.26 
 
 
193 aa  228  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  46.48 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  41.12 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  37.74 
 
 
212 aa  148  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  36.97 
 
 
213 aa  145  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  38.5 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  38.97 
 
 
213 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  36.68 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  34.93 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  36.23 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  30.66 
 
 
213 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  28.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  28.17 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  29.25 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  38.26 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  27.07 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  23.04 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  25.35 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  27.85 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>