24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1096 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  65.08 
 
 
213 aa  261  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  59.26 
 
 
211 aa  228  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  42.33 
 
 
214 aa  160  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  39.27 
 
 
213 aa  138  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  38.74 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  36.84 
 
 
215 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  36.84 
 
 
212 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  31.94 
 
 
213 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  33.88 
 
 
213 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  33.68 
 
 
212 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  30.05 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  29.59 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  29.89 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  28.34 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  29.29 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  27.37 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  33.62 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  27.84 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  24.86 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  27.6 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  27.16 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  21.88 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>