25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00400 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  39.05 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  36.97 
 
 
211 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  38.1 
 
 
213 aa  144  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  35.1 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  37.44 
 
 
215 aa  138  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  33.98 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  34.11 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  30.95 
 
 
213 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  32.13 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  30.62 
 
 
212 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  30.66 
 
 
213 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  29.91 
 
 
208 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  31.94 
 
 
193 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  31.9 
 
 
213 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  29.86 
 
 
212 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  30.29 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  36.51 
 
 
145 aa  90.1  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  29.91 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  30.52 
 
 
169 aa  85.5  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  27.1 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  26.37 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>