24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2772 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  349  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  35.29 
 
 
215 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  34.42 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  32.17 
 
 
213 aa  90.5  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  34.81 
 
 
214 aa  89  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  34.87 
 
 
212 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  30.52 
 
 
213 aa  85.5  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  36.59 
 
 
213 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  35.77 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  34.21 
 
 
209 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  29.03 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  29.79 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  27.5 
 
 
213 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  26.47 
 
 
233 aa  60.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  27.69 
 
 
145 aa  57.4  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  23.81 
 
 
208 aa  54.3  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  25.95 
 
 
209 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  28.85 
 
 
220 aa  44.3  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  23.65 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>