25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0444 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  38.18 
 
 
212 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  37.38 
 
 
208 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  34.09 
 
 
220 aa  121  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  32.13 
 
 
213 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  32.59 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  33.04 
 
 
213 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  34.67 
 
 
213 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  29.78 
 
 
214 aa  95.9  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  31.53 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  30.91 
 
 
160 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  29.65 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  29.46 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  27.07 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  34.51 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  27.98 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  28.89 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  27.51 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  25.57 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  28.89 
 
 
209 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  26.47 
 
 
169 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  27.84 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>