21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0939 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0939  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  333  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  36.71 
 
 
208 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  32.69 
 
 
212 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  30.91 
 
 
233 aa  91.3  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  30.86 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  80.5  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2359  hypothetical protein  28.28 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386183  normal  0.488384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  27.1 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  30.43 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  33.74 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  33.13 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  29.22 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  33.12 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  30.63 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  31.82 
 
 
213 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  26.25 
 
 
213 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  26.11 
 
 
213 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  27.85 
 
 
211 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  27.74 
 
 
221 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  25.19 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>