23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3954 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3954  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0922  hypothetical protein  98.47 
 
 		 213 aa  265  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00392461  hitchhiker  0.00000000148621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2013  hypothetical protein  43.31 
 
 		 213 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.174769  hitchhiker  0.000784193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1094  hypothetical protein  42.52 
 
 		 213 aa  90.9  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00400  hypothetical protein  36.51 
 
 		 213 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0348  hypothetical protein  35.9 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1832  hypothetical protein  40.52 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0254635  hitchhiker  0.00000000532749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1834  hypothetical protein  38.26 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  hitchhiker  0.00000000577529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3152  hypothetical protein  32.58 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3210  hypothetical protein  37.29 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.071864  normal  0.937878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0444  hypothetical protein  34.51 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0924  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000933564  hitchhiker  0.000000000105152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2847  hypothetical protein  35.21 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.161365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3209  hypothetical protein  34.71 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00974735  normal  0.788184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3153  hypothetical protein  36.59 
 
 		 212 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2015  hypothetical protein  36.21 
 
 		 213 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.293977  hitchhiker  0.00160797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2462  hypothetical protein  27.27 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1096  hypothetical protein  33.62 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2772  hypothetical protein  27.69 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0569717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3151  hypothetical protein  36.75 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2869  hypothetical protein  32.23 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113209  normal  0.67039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2360  hypothetical protein  29.91 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134121  normal  0.345734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2107  hypothetical protein  27.66 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267353  normal  0.306871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>