More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2917 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_2917  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
371 aa  719    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177659  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4344  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.83 
 
 
376 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2421  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.97 
 
 
378 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.961626  normal  0.0795977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.76 
 
 
382 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1473  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.93 
 
 
379 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.928571  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4240  8-amino-7-oxononanoate synthase  59 
 
 
408 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.609227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.55 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3320  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.63 
 
 
376 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.56 
 
 
388 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2099  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.75 
 
 
384 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.851935  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2822  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.47 
 
 
382 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0429  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.42 
 
 
378 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0491  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.87 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1254  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.26 
 
 
369 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2918  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.31 
 
 
387 aa  315  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2978  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.42 
 
 
374 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.748921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.45 
 
 
396 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1911  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.32 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 
388 aa  212  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.96 
 
 
378 aa  212  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.21 
 
 
397 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.39 
 
 
399 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2998  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.61 
 
 
369 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168149  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.94 
 
 
384 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06645  probable 8-amino-7-oxononanoate synthase (Eurofung)  36.87 
 
 
412 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1489  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.05 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.24 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.75 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.17 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5561  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.89 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.82 
 
 
391 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.32 
 
 
390 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
394 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.07 
 
 
396 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  34.39 
 
 
379 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
397 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.64 
 
 
392 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.65 
 
 
397 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.05 
 
 
390 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.76 
 
 
389 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.73 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.89 
 
 
392 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
385 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
385 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.95 
 
 
387 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.52 
 
 
388 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 
385 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.06 
 
 
384 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.78 
 
 
388 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.44 
 
 
388 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.94 
 
 
385 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
381 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16701  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  31.71 
 
 
379 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.601431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.71 
 
 
385 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0857  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 
383 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0484111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.71 
 
 
385 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.78 
 
 
400 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 
384 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.73 
 
 
398 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 
396 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0816  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.497874  normal  0.203864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.68 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.21 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  38.79 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.34 
 
 
370 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05380  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  34.09 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0461719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1419  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.72 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  35 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.73 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.07 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.71 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.75 
 
 
390 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.29 
 
 
397 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.51 
 
 
384 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0999  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  36.34 
 
 
380 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.13 
 
 
383 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.99 
 
 
386 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.07 
 
 
395 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.85 
 
 
395 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.87 
 
 
383 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.52 
 
 
393 aa  182  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.28 
 
 
396 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.15 
 
 
395 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.99 
 
 
381 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0950  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.53 
 
 
367 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2875  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
383 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.26 
 
 
394 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.25 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.01 
 
 
389 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.51 
 
 
384 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.97 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0171  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.72 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.1403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.69 
 
 
403 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.63 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2048  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.71 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.44 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>