More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2998 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2998  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
369 aa  758    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1911  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.08 
 
 
377 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2978  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.32 
 
 
374 aa  352  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.748921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5561  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.2 
 
 
395 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.8 
 
 
378 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1489  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.05 
 
 
375 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05380  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  44.2 
 
 
381 aa  315  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0461719  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06645  probable 8-amino-7-oxononanoate synthase (Eurofung)  44.02 
 
 
412 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 
394 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.1 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.62 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36165  predicted protein  38.6 
 
 
448 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.68 
 
 
382 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.68 
 
 
370 aa  229  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.82 
 
 
401 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  37.54 
 
 
396 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.99 
 
 
390 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.7 
 
 
390 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.31 
 
 
391 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.23 
 
 
401 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.59 
 
 
392 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.28 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1473  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.46 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.928571  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2421  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.44 
 
 
378 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.961626  normal  0.0795977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3320  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.01 
 
 
376 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.04 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4344  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
376 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.61 
 
 
388 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2822  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.01 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.5 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.87 
 
 
394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.04 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.78 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.78 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2099  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.7 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.851935  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.78 
 
 
391 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.29 
 
 
397 aa  212  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.79 
 
 
399 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.28 
 
 
389 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.36 
 
 
391 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.37 
 
 
400 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.12 
 
 
389 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.51 
 
 
399 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.68 
 
 
385 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.51 
 
 
377 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0429  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.24 
 
 
378 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0491  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.24 
 
 
378 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2918  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.38 
 
 
387 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.79 
 
 
395 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.79 
 
 
395 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.79 
 
 
395 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.79 
 
 
395 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.7 
 
 
390 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  32.8 
 
 
395 aa  205  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
395 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.06 
 
 
388 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 
395 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.26 
 
 
395 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.39 
 
 
395 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.1 
 
 
396 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.5 
 
 
389 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.39 
 
 
395 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.51 
 
 
395 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  34.96 
 
 
446 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4240  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.26 
 
 
408 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.609227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.56 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.22 
 
 
391 aa  200  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.54 
 
 
395 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.62 
 
 
385 aa  199  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02260  8-amino-7-oxononanoatesynthase, putative  36.6 
 
 
447 aa  199  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.201305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.46 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.07 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.03 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1419  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.57 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  38 
 
 
407 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0821  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.5 
 
 
370 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625385  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.8 
 
 
388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.9 
 
 
381 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.32 
 
 
384 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  32.37 
 
 
396 aa  195  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  36.01 
 
 
396 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.24 
 
 
384 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.18 
 
 
398 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.9 
 
 
391 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.18 
 
 
398 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.8 
 
 
390 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.19 
 
 
397 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.4 
 
 
384 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.18 
 
 
397 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.73 
 
 
386 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.46 
 
 
391 aa  193  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.31 
 
 
381 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.45 
 
 
388 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.31 
 
 
384 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.71 
 
 
385 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1254  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.4 
 
 
369 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.42 
 
 
385 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.71 
 
 
385 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.71 
 
 
385 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>