132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0258 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0258  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0259  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  62.64 
 
 		 743 aa  215  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2028  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.05 
 
 		 767 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000881449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.71 
 
 		 595 aa  77.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.71 
 
 		 595 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.71 
 
 		 595 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  34.85 
 
 		 629 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  29.94 
 
 		 623 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  34.07 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  34.81 
 
 		 589 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.72 
 
 		 572 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.89 
 
 		 600 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.41 
 
 		 583 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  32.17 
 
 		 745 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.92 
 
 		 608 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.03 
 
 		 583 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.67 
 
 		 752 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.08 
 
 		 570 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  30.94 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  31.11 
 
 		 571 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  32 
 
 		 794 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.25 
 
 		 624 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.23 
 
 		 611 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.19 
 
 		 606 aa  61.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  24.22 
 
 		 757 aa  60.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.91 
 
 		 592 aa  60.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.77 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.77 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  29.92 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  35.54 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.53 
 
 		 631 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.5 
 
 		 654 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28 
 
 		 589 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  27.48 
 
 		 731 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  30.77 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.22 
 
 		 592 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  28.8 
 
 		 603 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.5 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.57 
 
 		 624 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  28.23 
 
 		 623 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.5 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.75 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.89 
 
 		 567 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.89 
 
 		 567 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.89 
 
 		 567 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28 
 
 		 489 aa  54.7  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.05 
 
 		 567 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.73 
 
 		 563 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  28.81 
 
 		 608 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.21 
 
 		 628 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.05 
 
 		 567 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  28.8 
 
 		 630 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.64 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.46 
 
 		 604 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.65 
 
 		 607 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 		 619 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 		 619 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 		 619 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.86 
 
 		 605 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.81 
 
 		 610 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  26.47 
 
 		 639 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.35 
 
 		 613 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  29.92 
 
 		 558 aa  52.4  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.13 
 
 		 810 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.88 
 
 		 619 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.01 
 
 		 586 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.32 
 
 		 611 aa  51.6  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  21.37 
 
 		 649 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.81 
 
 		 613 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.2 
 
 		 613 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.48 
 
 		 612 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.71 
 
 		 609 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  26.51 
 
 		 597 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  26.67 
 
 		 604 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.67 
 
 		 612 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.71 
 
 		 585 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28 
 
 		 628 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.54 
 
 		 602 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.81 
 
 		 607 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.37 
 
 		 593 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  25.93 
 
 		 642 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 		 596 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0207  thioredoxin:cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.23 
 
 		 624 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.98 
 
 		 590 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.34 
 
 		 570 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.98 
 
 		 590 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.48 
 
 		 616 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.92 
 
 		 610 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  25.64 
 
 		 632 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  27.96 
 
 		 603 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.87 
 
 		 581 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.68 
 
 		 595 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>