49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1780 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1690  hypothetical protein  72.31 
 
 
614 aa  926    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.0000220008  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0509  hypothetical protein  66.29 
 
 
613 aa  870    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1592  hypothetical protein  68.89 
 
 
613 aa  860    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1780  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1231    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000813258 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0175  hypothetical protein  34.71 
 
 
650 aa  343  4e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.432348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1177  protein of unknown function DUF814  26.73 
 
 
609 aa  249  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0157  hypothetical protein  30.53 
 
 
601 aa  243  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0662  protein of unknown function DUF814  29.43 
 
 
589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2928  Fibronectin-binding A domain protein  28.69 
 
 
707 aa  177  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256902  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  26.76 
 
 
663 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0566  hypothetical protein  24.6 
 
 
680 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.415029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0055  hypothetical protein  24.82 
 
 
652 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2189  Fibronectin-binding A domain protein  28.18 
 
 
708 aa  169  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1632  hypothetical protein  24.38 
 
 
680 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0437  hypothetical protein  27.48 
 
 
627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262278  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1566  protein of unknown function DUF814  25.69 
 
 
629 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.853541  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1479  Fibronectin-binding A domain protein  27.76 
 
 
733 aa  164  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0745  hypothetical protein  30.4 
 
 
610 aa  162  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1534  hypothetical protein  30.26 
 
 
641 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1330  hypothetical protein  28 
 
 
631 aa  157  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.507535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0936  hypothetical protein  29 
 
 
632 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0251474  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0563  hypothetical protein  23.29 
 
 
686 aa  148  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.181416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0281  hypothetical protein  25.12 
 
 
680 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000238362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0866  Fibronectin-binding A domain protein  25.56 
 
 
727 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2853  Fibronectin-binding A domain protein  26.21 
 
 
723 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0540  hypothetical protein  27.32 
 
 
642 aa  143  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0523546  normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0351  hypothetical protein  23.66 
 
 
680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  29.2 
 
 
797 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42643  predicted protein  31.5 
 
 
1238 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10769  DUF814 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09170)  27.09 
 
 
1100 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0496389  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32024  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  29.29 
 
 
1038 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873906  normal  0.425602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1812  Fibronectin-binding A domain protein  21.19 
 
 
568 aa  61.2  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88476  predicted protein  24.19 
 
 
1069 aa  60.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289922  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1053  Fibronectin-binding A domain protein  21.53 
 
 
570 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000411066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1943  Fibronectin-binding A domain protein  23.28 
 
 
579 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0581  fibronectin-binding A-like protein  22.18 
 
 
588 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3698  fibronectin-binding A domain-containing protein  23.46 
 
 
569 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2527  fibronectin-binding A domain-containing protein  22.08 
 
 
569 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1324  Fibronectin-binding A domain protein  23.06 
 
 
576 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2377  Fibronectin-binding A domain protein  24.91 
 
 
513 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1823  Fibronectin-binding A domain protein  20.92 
 
 
585 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09780  Fibronectin-binding A domain protein  23.23 
 
 
585 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0960  fibronectin-binding protein-like protein A  29.27 
 
 
552 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  27.98 
 
 
1189 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1292  fibronectin-binding A domain-containing protein  22.1 
 
 
565 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.742496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1267  fibronectin-binding A domain-containing protein  22.1 
 
 
565 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.276273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 
1189 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0886  hypothetical protein  23.77 
 
 
584 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1190  adherence and virulence protein A  20.85 
 
 
551 aa  44.3  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>