89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1575 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  100 
 
 
797 aa  1621    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  57.3 
 
 
663 aa  852    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1534  hypothetical protein  39.11 
 
 
641 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0866  Fibronectin-binding A domain protein  36.02 
 
 
727 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2928  Fibronectin-binding A domain protein  35.8 
 
 
707 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2853  Fibronectin-binding A domain protein  35.47 
 
 
723 aa  436  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1479  Fibronectin-binding A domain protein  33.76 
 
 
733 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0563  hypothetical protein  31.89 
 
 
686 aa  342  1e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.181416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0566  hypothetical protein  31.26 
 
 
680 aa  331  3e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.415029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1632  hypothetical protein  31.18 
 
 
680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2189  Fibronectin-binding A domain protein  40.05 
 
 
708 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1330  hypothetical protein  33.01 
 
 
631 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.507535 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0281  hypothetical protein  30.86 
 
 
680 aa  317  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000238362 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0351  hypothetical protein  30.36 
 
 
680 aa  292  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1566  protein of unknown function DUF814  41.23 
 
 
629 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.853541  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0936  hypothetical protein  40.95 
 
 
632 aa  281  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0251474  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0540  hypothetical protein  37.99 
 
 
642 aa  266  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0523546  normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0437  hypothetical protein  39.45 
 
 
627 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262278  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0662  protein of unknown function DUF814  32.92 
 
 
589 aa  206  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1177  protein of unknown function DUF814  31.5 
 
 
609 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0745  hypothetical protein  30.18 
 
 
610 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0157  hypothetical protein  31.74 
 
 
601 aa  182  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0175  hypothetical protein  31.17 
 
 
650 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.432348 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10769  DUF814 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09170)  24.69 
 
 
1100 aa  170  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0496389  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1690  hypothetical protein  26.02 
 
 
614 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.0000220008  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0055  hypothetical protein  27.12 
 
 
652 aa  154  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0509  hypothetical protein  28.92 
 
 
613 aa  145  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42643  predicted protein  25.14 
 
 
1238 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1592  hypothetical protein  23.19 
 
 
613 aa  137  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88476  predicted protein  23.79 
 
 
1069 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289922  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1780  hypothetical protein  28.72 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000813258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1823  Fibronectin-binding A domain protein  24.32 
 
 
585 aa  111  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0581  fibronectin-binding A-like protein  35.4 
 
 
588 aa  99  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3974  putative fibronectin-binding protein  26.06 
 
 
569 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.27289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09780  Fibronectin-binding A domain protein  30.42 
 
 
585 aa  92  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0886  hypothetical protein  23.25 
 
 
584 aa  90.1  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1269  putative fibronectin-binding protein  25.73 
 
 
569 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1815  adherence and virulence protein A  31.14 
 
 
575 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3889  putative fibronectin-binding protein  30.77 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000127726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3923  putative fibronectin-binding protein  30.77 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2527  fibronectin-binding A domain-containing protein  24.72 
 
 
569 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2101  fibronectin-binding protein  30.7 
 
 
575 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3616  fibronectin-binding protein  30.77 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32024  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  28.29 
 
 
1038 aa  83.2  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873906  normal  0.425602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3634  fibronectin-binding protein  30.77 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3919  fibronectin/fibrinogen-binding protein, putative  30.77 
 
 
569 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3726  fibronectin/fibrinogen-binding protein  30.36 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4013  fibronectin/fibrinogen-binding protein  30.36 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3698  fibronectin-binding A domain-containing protein  24.26 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1275  RNA-binding protein-like protein  29.82 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1964  Fibronectin-binding A domain protein  26.76 
 
 
592 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1053  Fibronectin-binding A domain protein  24.41 
 
 
570 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000411066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2902  fibronectin-binding A domain-containing protein  21.14 
 
 
594 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000222554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1943  Fibronectin-binding A domain protein  27.31 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3916  Fibronectin-binding A domain protein  24.94 
 
 
652 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1767  fibronectin-binding A domain-containing protein  33.72 
 
 
570 aa  71.6  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0286424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1691  fibronectin-binding A domain-containing protein  34.78 
 
 
592 aa  71.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1325  Fibronectin-binding A domain protein  32.16 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1324  Fibronectin-binding A domain protein  28.64 
 
 
576 aa  62.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1812  Fibronectin-binding A domain protein  35.59 
 
 
568 aa  61.2  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1314  Fibronectin-binding A domain protein  33.85 
 
 
594 aa  60.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2332  Fibronectin-binding A domain protein  27.85 
 
 
595 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4287  fibronectin-binding A domain-containing protein  25.19 
 
 
583 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0863996 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0963  Fibronectin-binding A domain protein  26.32 
 
 
582 aa  55.8  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2377  Fibronectin-binding A domain protein  27.85 
 
 
513 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1077  fibronectin-binding protein  29.35 
 
 
547 aa  55.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.224982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1011  fibronectin-binding protein  29.41 
 
 
563 aa  55.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000321701  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1871  Fibronectin-binding A domain protein  27.5 
 
 
584 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0246704  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0569  fibronectin-binding A domain-containing protein  25.83 
 
 
549 aa  53.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0555  fibronectin-binding A domain-containing protein  27.86 
 
 
549 aa  53.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00535298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3600  fibronectin-binding A domain-containing protein  26.07 
 
 
583 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0960  fibronectin-binding protein-like protein A  26.44 
 
 
552 aa  50.8  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1190  adherence and virulence protein A  26.99 
 
 
551 aa  50.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1267  fibronectin-binding A domain-containing protein  20.97 
 
 
565 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.276273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1292  fibronectin-binding A domain-containing protein  20.97 
 
 
565 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.742496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0932  fibronectin-binding A domain-containing protein  32 
 
 
560 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1452  fibronectin-binding protein  28.9 
 
 
564 aa  49.7  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429476  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2344  hypothetical protein  30.86 
 
 
515 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000192452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1735  protein of unknown function DUF814  38.57 
 
 
518 aa  49.3  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.676814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1084  hypothetical protein  32.22 
 
 
579 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0294  protein of unknown function DUF814  38.57 
 
 
577 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0641  Fibronectin-binding A domain-containing protein  25.42 
 
 
505 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0618  fibronectin-binding A domain-containing protein  25.97 
 
 
578 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0695  protein of unknown function DUF814  31.18 
 
 
508 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000721327  unclonable  0.00000000020456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2801  RNA-binding protein  35.82 
 
 
520 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0364556  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0538  hypothetical protein  31.18 
 
 
508 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.24326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1297  fibronectin-binding A domain-containing protein  24.71 
 
 
586 aa  45.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2635  protein of unknown function DUF814  24.1 
 
 
557 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0171  hypothetical protein  24.7 
 
 
496 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0303739  normal  0.463043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>