38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42643 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42643  predicted protein  100 
 
 
1238 aa  2563    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10769  DUF814 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09170)  28.51 
 
 
1100 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0496389  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88476  predicted protein  30.47 
 
 
1069 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289922  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  26.58 
 
 
663 aa  155  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0563  hypothetical protein  28.28 
 
 
686 aa  148  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.181416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0566  hypothetical protein  26.56 
 
 
680 aa  139  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.415029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1632  hypothetical protein  26.02 
 
 
680 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2189  Fibronectin-binding A domain protein  29.31 
 
 
708 aa  135  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0281  hypothetical protein  26.02 
 
 
680 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000238362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  25.14 
 
 
797 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0157  hypothetical protein  32.86 
 
 
601 aa  130  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0745  hypothetical protein  31.51 
 
 
610 aa  128  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1177  protein of unknown function DUF814  33.99 
 
 
609 aa  128  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0351  hypothetical protein  25.82 
 
 
680 aa  127  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2853  Fibronectin-binding A domain protein  25.7 
 
 
723 aa  127  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1479  Fibronectin-binding A domain protein  24.36 
 
 
733 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0055  hypothetical protein  33.01 
 
 
652 aa  127  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0866  Fibronectin-binding A domain protein  26.39 
 
 
727 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0540  hypothetical protein  26.65 
 
 
642 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0523546  normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32024  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  29.21 
 
 
1038 aa  122  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873906  normal  0.425602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1566  protein of unknown function DUF814  32.88 
 
 
629 aa  119  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.853541  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2928  Fibronectin-binding A domain protein  24.35 
 
 
707 aa  118  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0936  hypothetical protein  27.46 
 
 
632 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0251474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1330  hypothetical protein  35.93 
 
 
631 aa  116  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.507535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0662  protein of unknown function DUF814  36.36 
 
 
589 aa  114  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1534  hypothetical protein  24.13 
 
 
641 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0437  hypothetical protein  35.58 
 
 
627 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262278  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0175  hypothetical protein  35.8 
 
 
650 aa  102  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.432348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1690  hypothetical protein  34.69 
 
 
614 aa  102  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.0000220008  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0509  hypothetical protein  25 
 
 
613 aa  96.3  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1780  hypothetical protein  31.5 
 
 
616 aa  94.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000813258 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1592  hypothetical protein  30.52 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2332  Fibronectin-binding A domain protein  33.77 
 
 
595 aa  50.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0963  Fibronectin-binding A domain protein  30.12 
 
 
582 aa  47  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1823  Fibronectin-binding A domain protein  25 
 
 
585 aa  45.8  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1053  Fibronectin-binding A domain protein  31.37 
 
 
570 aa  45.8  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000411066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0942  hypothetical protein  26.15 
 
 
541 aa  45.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0886  hypothetical protein  29.58 
 
 
584 aa  44.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>