81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0936 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0936  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1292    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0251474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0437  hypothetical protein  56.4 
 
 
627 aa  672    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262278  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1330  hypothetical protein  59.27 
 
 
631 aa  736    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.507535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1566  protein of unknown function DUF814  61.27 
 
 
629 aa  793    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.853541  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0540  hypothetical protein  50.94 
 
 
642 aa  617  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0523546  normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  38.1 
 
 
663 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0866  Fibronectin-binding A domain protein  34.07 
 
 
727 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2853  Fibronectin-binding A domain protein  34.77 
 
 
723 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2928  Fibronectin-binding A domain protein  33.33 
 
 
707 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2189  Fibronectin-binding A domain protein  32.91 
 
 
708 aa  352  1e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1479  Fibronectin-binding A domain protein  33.06 
 
 
733 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1534  hypothetical protein  34.46 
 
 
641 aa  327  3e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  39.45 
 
 
797 aa  266  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0563  hypothetical protein  29.36 
 
 
686 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.181416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0566  hypothetical protein  28.59 
 
 
680 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.415029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0351  hypothetical protein  28.89 
 
 
680 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1632  hypothetical protein  27.55 
 
 
680 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0281  hypothetical protein  28.75 
 
 
680 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000238362 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0662  protein of unknown function DUF814  29.57 
 
 
589 aa  243  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1177  protein of unknown function DUF814  26.1 
 
 
609 aa  183  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0157  hypothetical protein  25.28 
 
 
601 aa  182  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0745  hypothetical protein  28.9 
 
 
610 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0055  hypothetical protein  24.72 
 
 
652 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0175  hypothetical protein  28.2 
 
 
650 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.432348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0509  hypothetical protein  26.7 
 
 
613 aa  155  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1780  hypothetical protein  29.07 
 
 
616 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000813258 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1690  hypothetical protein  27.71 
 
 
614 aa  146  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.0000220008  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1592  hypothetical protein  27.3 
 
 
613 aa  145  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42643  predicted protein  27.46 
 
 
1238 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88476  predicted protein  24.49 
 
 
1069 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289922  normal  0.626674 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10769  DUF814 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09170)  32.29 
 
 
1100 aa  97.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0496389  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2527  fibronectin-binding A domain-containing protein  25.47 
 
 
569 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3923  putative fibronectin-binding protein  24.87 
 
 
569 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3974  putative fibronectin-binding protein  24.78 
 
 
569 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.27289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3634  fibronectin-binding protein  24.7 
 
 
569 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3616  fibronectin-binding protein  24.7 
 
 
569 aa  89  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3726  fibronectin/fibrinogen-binding protein  24.53 
 
 
569 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4013  fibronectin/fibrinogen-binding protein  24.53 
 
 
569 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0886  hypothetical protein  25.71 
 
 
584 aa  88.2  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3889  putative fibronectin-binding protein  24.36 
 
 
569 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000127726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3919  fibronectin/fibrinogen-binding protein, putative  24.7 
 
 
569 aa  87  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1269  putative fibronectin-binding protein  24.78 
 
 
569 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1943  Fibronectin-binding A domain protein  24.83 
 
 
579 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1767  fibronectin-binding A domain-containing protein  21.19 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0286424  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0960  fibronectin-binding protein-like protein A  23.21 
 
 
552 aa  79.7  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2902  fibronectin-binding A domain-containing protein  22.6 
 
 
594 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000222554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3916  Fibronectin-binding A domain protein  32.92 
 
 
652 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2332  Fibronectin-binding A domain protein  38.85 
 
 
595 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1815  adherence and virulence protein A  20.97 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0581  fibronectin-binding A-like protein  21.64 
 
 
588 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1053  Fibronectin-binding A domain protein  24.34 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000411066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0555  fibronectin-binding A domain-containing protein  24.06 
 
 
549 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00535298  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32024  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  28.78 
 
 
1038 aa  70.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873906  normal  0.425602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1812  Fibronectin-binding A domain protein  22.48 
 
 
568 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1691  fibronectin-binding A domain-containing protein  33.14 
 
 
592 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09780  Fibronectin-binding A domain protein  33.12 
 
 
585 aa  68.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1823  Fibronectin-binding A domain protein  22.12 
 
 
585 aa  67  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0963  Fibronectin-binding A domain protein  33.61 
 
 
582 aa  66.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1450  fibronectin-binding protein  22.99 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1292  fibronectin-binding A domain-containing protein  34.78 
 
 
565 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.742496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1267  fibronectin-binding A domain-containing protein  34.78 
 
 
565 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.276273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2101  fibronectin-binding protein  29.27 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1324  Fibronectin-binding A domain protein  23.57 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1190  adherence and virulence protein A  22.57 
 
 
551 aa  61.2  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252284  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0569  fibronectin-binding A domain-containing protein  22.77 
 
 
549 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1454  RNA-binding protein  24.43 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1275  RNA-binding protein-like protein  30.3 
 
 
601 aa  59.7  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1314  Fibronectin-binding A domain protein  34.33 
 
 
594 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2041  Fibronectin-binding A domain protein  20.04 
 
 
532 aa  58.9  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.662273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1297  fibronectin-binding A domain-containing protein  35.66 
 
 
586 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0775  fibronectin/fibrinogen binding protein  32.56 
 
 
565 aa  57.8  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0932  fibronectin-binding A domain-containing protein  23.2 
 
 
560 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1639  Fibronectin-binding A domain protein  22.61 
 
 
573 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1964  Fibronectin-binding A domain protein  27.04 
 
 
592 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1077  fibronectin-binding protein  26.96 
 
 
547 aa  49.7  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.224982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0857  fibronectin-binding A domain-containing protein  30.85 
 
 
525 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1325  Fibronectin-binding A domain protein  28.57 
 
 
579 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0725  fibronectin-binding protein, putative  26.29 
 
 
547 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.657746  normal  0.950358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0618  fibronectin-binding A domain-containing protein  20.92 
 
 
578 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1731  secreted protein MPB70 precursor-like  32 
 
 
562 aa  44.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1452  fibronectin-binding protein  28.24 
 
 
564 aa  44.3  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>