75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00774 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00774  mosc  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  54.05 
 
 
184 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  57.04 
 
 
144 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  49.43 
 
 
206 aa  160  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  54.97 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  52.94 
 
 
167 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  54.11 
 
 
167 aa  153  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  53.79 
 
 
165 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  50.66 
 
 
175 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  49.02 
 
 
174 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  49.67 
 
 
177 aa  147  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  55.24 
 
 
155 aa  147  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  54.25 
 
 
178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  51.01 
 
 
181 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  54.48 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  50.34 
 
 
159 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  38.85 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  37.59 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  39.71 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  38.82 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  42.28 
 
 
181 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  37.11 
 
 
174 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  39.49 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  37.23 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  39.23 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  38.76 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  36.72 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  36.54 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  37.23 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  37.06 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  36.24 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  35.81 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  30.63 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  38.93 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  35.71 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  40.46 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  40.46 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  40.46 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  32.87 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  37.96 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  32.67 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  30.08 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  34.81 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  31.88 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  29.29 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  28.87 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  30.99 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  35.51 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  32.89 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1370  MOSC domain protein  29.73 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  32.82 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  30.47 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  32.82 
 
 
148 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  33.56 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  29.13 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  39.47 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  31.62 
 
 
241 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  24.66 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  25.69 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  32.31 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  32.79 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  28.81 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  31.43 
 
 
217 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  30.13 
 
 
234 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  34.95 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  46.81 
 
 
390 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  23.97 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>