42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3575 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  75.26 
 
 
190 aa  286  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  63.64 
 
 
197 aa  218  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  67.55 
 
 
187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  53.42 
 
 
176 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  42.86 
 
 
153 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  40.26 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  39.55 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  37.23 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  37.84 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  33.58 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  36.64 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  32.64 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  34.38 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  35.48 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  36.76 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  34.07 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  34.85 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  36.42 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  36.96 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
153 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  35.56 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  32.24 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  33.83 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  36.89 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  27.92 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  30.64 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  33.6 
 
 
159 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  36.27 
 
 
155 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  30.99 
 
 
143 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  29.29 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  29.45 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  28.77 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  31.33 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  36.73 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  27.74 
 
 
146 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  30.77 
 
 
164 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  32.41 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  32.41 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  32.41 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  27.01 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>