30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1370 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1370  MOSC domain protein  100 
 
 
161 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  38.27 
 
 
205 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  31.97 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  29.87 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  29.73 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0149  hypothetical protein  32.93 
 
 
220 aa  47.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1630  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  35.29 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1479  hypothetical protein  28.25 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  36.9 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  34.57 
 
 
205 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0030  MOSC domain containing protein  32.47 
 
 
230 aa  44.7  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
206 aa  43.9  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  29.84 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  39.24 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  27.27 
 
 
153 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2884  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 
181 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211052  normal  0.150346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  33.55 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4395  MOSC domain containing protein  33.77 
 
 
209 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772534  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  36.84 
 
 
142 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4643  MOSC domain-containing protein  32.47 
 
 
218 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1855  mosc domain-containing protein  32.47 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  30.2 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  31.13 
 
 
234 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  28.8 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
214 aa  40.8  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  30.28 
 
 
241 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  31.01 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>